15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03500 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_12408  VAC8 (JCVI)  66.67 
 
 		 579 aa  758    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03500  beta-catenin, putative  100 
 
 		 660 aa  1340    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00903794  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  62.04 
 
 		 561 aa  669    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27814  predicted protein  29.51 
 
 		 1546 aa  76.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.208046  normal  0.12178 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29174  predicted protein  27.27 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02142  Karyopherin alphaPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X175]  22.15 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.613304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42512  predicted protein  22.64 
 
 		 1096 aa  60.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526477  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45154  predicted protein  24.39 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04770  Importin alpha subunit, putative  21.74 
 
 		 536 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67974  Importin alpha subunit (Karyopherin alpha subunit) (Serine-rich RNA polymerase I suppressor protein)  24.08 
 
 		 544 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.53 
 
 		 490 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49176  predicted protein  31.78 
 
 		 869 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.450709  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46552  predicted protein  24.2 
 
 		 525 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105236  normal  0.308215 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30877  predicted protein  29.41 
 
 		 456 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1094 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>