11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45249 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45249  predicted protein  100 
 
 
1421 aa  2909    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45154  predicted protein  24.4 
 
 
1055 aa  111  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37861  predicted protein  24.81 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49160  predicted protein  28.28 
 
 
261 aa  65.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49176  predicted protein  28.57 
 
 
869 aa  64.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.450709  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45159  predicted protein  24.51 
 
 
683 aa  60.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183197  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74520  vacuole memebrane protein required for vacuole inheritance  27.3 
 
 
561 aa  57.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49589  predicted protein  29.6 
 
 
332 aa  57  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.966771  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48422  predicted protein  33.04 
 
 
702 aa  49.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49243  predicted protein  24.89 
 
 
576 aa  46.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312572  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47047  predicted protein  22.76 
 
 
1325 aa  45.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>