58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43342 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43342  predicted protein  100 
 
 
450 aa  902    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47352  predicted protein  39.87 
 
 
501 aa  300  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32535  predicted protein  44.01 
 
 
370 aa  273  5.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264951  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33726  predicted protein  28.4 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26318  DMT family transporter: drug/metabolite  26.92 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48145  predicted protein  26.37 
 
 
462 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196185  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32216  DMT family transporter: drug/metabolite  25.97 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681934  normal  0.0531718 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45965  predicted protein  23.51 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  24.23 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40588  predicted protein  23.48 
 
 
387 aa  60.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  23.63 
 
 
303 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  22.02 
 
 
299 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  22.01 
 
 
322 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  25 
 
 
298 aa  57  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
283 aa  57  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 
289 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  27.57 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  27.57 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  28.99 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  28.99 
 
 
295 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  22.81 
 
 
293 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  53.5  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  22.82 
 
 
301 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.96 
 
 
294 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.11 
 
 
312 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  22.8 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  23.35 
 
 
303 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  25.1 
 
 
299 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  28.19 
 
 
295 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  23.16 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  22.78 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  26.61 
 
 
297 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  28.97 
 
 
298 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  25.45 
 
 
307 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  26.36 
 
 
307 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  23.08 
 
 
303 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  22.8 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 
296 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  29.24 
 
 
293 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  24.06 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  24.06 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  24.06 
 
 
303 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  23.75 
 
 
288 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  27.08 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49268  predicted protein  21.34 
 
 
579 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  26.89 
 
 
323 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
291 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  25.68 
 
 
308 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  25.49 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.31 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  25.52 
 
 
297 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  25.52 
 
 
299 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18490  DMT family transporter: drug/metabolite  27.37 
 
 
302 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00171701  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45098  predicted protein  23.93 
 
 
647 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17940  membrane protein  21.1 
 
 
512 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  22.44 
 
 
305 aa  43.1  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>