26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43046 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  100 
 
 
301 aa  626  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  33.33 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  37 
 
 
330 aa  136  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32087  predicted protein  31.6 
 
 
297 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930891  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  32.61 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49373  predicted protein  32.71 
 
 
362 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.483156  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40753  predicted protein  33.92 
 
 
385 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.987836  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49894  predicted protein  33.63 
 
 
303 aa  119  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380598  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  28.83 
 
 
349 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31939  predicted protein  37.42 
 
 
261 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.469173  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  30.04 
 
 
307 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50251  predicted protein  26.6 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  27.54 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  25.77 
 
 
534 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  24.1 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  25 
 
 
464 aa  59.3  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  24.03 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  25.62 
 
 
479 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38865  predicted protein  24.59 
 
 
394 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  24.68 
 
 
629 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  22.93 
 
 
490 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  24.56 
 
 
457 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29226  predicted protein  25.41 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03795  G1/S-specific cyclin Cln1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03920)  23.95 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000280939  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  24.19 
 
 
467 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>