27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82085 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  100 
 
 		 317 aa  660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  57.54 
 
 		 629 aa  361  8e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  47.73 
 
 		 534 aa  286  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  46.99 
 
 		 479 aa  267  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  44.87 
 
 		 490 aa  255  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  42.91 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  37.16 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  33.74 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03795  G1/S-specific cyclin Cln1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03920)  34.13 
 
 		 419 aa  135  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000280939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  36.6 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119556  predicted protein  30.54 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.470219  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  28.9 
 
 		 467 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8598  predicted protein  59.38 
 
 		 64 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  30.07 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_17135  predicted protein  26.09 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28367  predicted protein  29.38 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_19145  predicted protein  31.45 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  27.49 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  24.03 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29283  predicted protein  24.02 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43757  cyc-like protein  26.35 
 
 		 491 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83689  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  20.83 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  22.09 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  25.6 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  20.65 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50251  predicted protein  21.02 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49894  predicted protein  24.08 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>