20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42423 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  100 
 
 
320 aa  659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49894  predicted protein  47.06 
 
 
303 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380598  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32087  predicted protein  39.9 
 
 
297 aa  149  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930891  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  35.94 
 
 
330 aa  126  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49373  predicted protein  31.84 
 
 
362 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.483156  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  32.61 
 
 
301 aa  122  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  35.56 
 
 
493 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40753  predicted protein  28.04 
 
 
385 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.987836  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31939  predicted protein  35.88 
 
 
261 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.469173  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50251  predicted protein  29.38 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  30.04 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  32.39 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38865  predicted protein  27.36 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  23.2 
 
 
457 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  25.58 
 
 
338 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  22.8 
 
 
427 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  32.26 
 
 
467 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  25.43 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  25 
 
 
534 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  25.6 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>