21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31942 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  100 
 
 
330 aa  687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  36.36 
 
 
493 aa  162  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  42.42 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  35.94 
 
 
320 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49894  predicted protein  34.2 
 
 
303 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380598  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32087  predicted protein  31.53 
 
 
297 aa  106  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930891  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49373  predicted protein  33.69 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.483156  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40753  predicted protein  33.79 
 
 
385 aa  89.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.987836  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31939  predicted protein  39.13 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.469173  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  27.85 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  25 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50251  predicted protein  28.49 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38865  predicted protein  29.21 
 
 
394 aa  62.8  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  24.87 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  21.94 
 
 
427 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  24.88 
 
 
457 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  25.16 
 
 
534 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  23.27 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  20.83 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  22.73 
 
 
464 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  22.44 
 
 
629 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>