24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46095 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  43.46 
 
 
338 aa  239  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  42.24 
 
 
490 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  37.16 
 
 
317 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  37.77 
 
 
534 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  36.29 
 
 
479 aa  159  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  35.25 
 
 
464 aa  155  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  40.48 
 
 
629 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119556  predicted protein  39.01 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.470219  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 
427 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8598  predicted protein  75 
 
 
64 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03795  G1/S-specific cyclin Cln1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03920)  30.67 
 
 
419 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000280939  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  36.99 
 
 
467 aa  93.6  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  39.69 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_17135  predicted protein  29.61 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  27.61 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  27.63 
 
 
493 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28367  predicted protein  28.19 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208891  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29283  predicted protein  24.47 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43757  cyc-like protein  24.86 
 
 
491 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83689  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  25.43 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28336  predicted protein  25.37 
 
 
340 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120857  normal  0.246625 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  23.27 
 
 
330 aa  45.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_19145  predicted protein  33.33 
 
 
322 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>