24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37002 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  100 
 
 
467 aa  964    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03795  G1/S-specific cyclin Cln1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03920)  43.04 
 
 
419 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000280939  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  39.81 
 
 
427 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  33.58 
 
 
457 aa  140  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  32.57 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  30.59 
 
 
629 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  29.82 
 
 
479 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  29.41 
 
 
534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  29.82 
 
 
317 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_19145  predicted protein  28.57 
 
 
322 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  36.99 
 
 
303 aa  94  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  31.32 
 
 
338 aa  93.2  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  32.61 
 
 
464 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119556  predicted protein  31.25 
 
 
331 aa  73.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.470219  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8598  predicted protein  51.67 
 
 
64 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28367  predicted protein  29.29 
 
 
319 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208891  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  22.92 
 
 
493 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  23.81 
 
 
349 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32087  predicted protein  24.26 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930891  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42423  predicted protein  32.26 
 
 
320 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.126266  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  24.19 
 
 
301 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  21.95 
 
 
307 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_17135  predicted protein  26.85 
 
 
234 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31942  predicted protein  23.73 
 
 
330 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>