22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81868 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  100 
 
 
464 aa  969    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  40.38 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  38.79 
 
 
534 aa  307  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  43.02 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  44.53 
 
 
629 aa  243  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  42.64 
 
 
317 aa  230  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  36.4 
 
 
338 aa  180  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  38.25 
 
 
303 aa  159  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
427 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03795  G1/S-specific cyclin Cln1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03920)  29.82 
 
 
419 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000280939  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119556  predicted protein  28.11 
 
 
331 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.470219  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  32.61 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8598  predicted protein  55.38 
 
 
64 aa  80.1  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_17135  predicted protein  26.83 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  27.97 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28367  predicted protein  28.49 
 
 
319 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208891  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  27.67 
 
 
307 aa  60.1  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  25 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_19145  predicted protein  33.7 
 
 
322 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43757  cyc-like protein  27.69 
 
 
491 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83689  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43034  predicted protein  22.63 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34956  predicted protein  23.6 
 
 
349 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.349779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>