19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04400 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE04400  cyclin-dependent protein kinase regulator, putative  100 
 
 
479 aa  993    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00160  g2/mitotic-specific cyclin cdc13, putative  39.03 
 
 
534 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.131083  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03648  G2/mitotic-specific cyclin-B [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30284]  37.42 
 
 
490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02137  G2/mitotic-specific cyclin (Clb3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16150)  52.16 
 
 
629 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528656  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82085  B-type cyclin  47.15 
 
 
317 aa  266  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81868  G2/mitotic-specific cyclin  43.36 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.361476  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39570  predicted protein  34.87 
 
 
338 aa  173  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00503372  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46095  predicted protein  36.29 
 
 
303 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00990  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 
427 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179742  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119556  predicted protein  34.09 
 
 
331 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.470219  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03795  G1/S-specific cyclin Cln1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03920)  30.08 
 
 
419 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000280939  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37002  predicted protein  28.9 
 
 
467 aa  106  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0120231  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_8598  predicted protein  54.69 
 
 
64 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91093  predicted protein  27.94 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018658  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_19145  predicted protein  37.78 
 
 
322 aa  63.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43046  predicted protein  25.62 
 
 
301 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_17135  predicted protein  22.64 
 
 
234 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28367  predicted protein  32.73 
 
 
319 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0208891  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41189  predicted protein  25.37 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>