More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24514 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24514  predicted protein  100 
 
 
326 aa  677    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.63338  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04150  conserved hypothetical protein  46.81 
 
 
418 aa  251  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133775  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05199  conserved hypothetical protein  48.59 
 
 
402 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64750  methionine aminopeptidase  44.72 
 
 
370 aa  241  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991291  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1491  methionine aminopeptidase, type I  43.88 
 
 
293 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.717494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  44.37 
 
 
285 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  44.72 
 
 
283 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1319  methionine aminopeptidase, type I  45.64 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123772  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15230  methionine aminopeptidase, type I  44.89 
 
 
289 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  42.86 
 
 
270 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2122  methionine aminopeptidase, type I  44.29 
 
 
290 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10020  methionine aminopeptidase, type I  43.86 
 
 
285 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  46.15 
 
 
329 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  44.76 
 
 
329 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  45.8 
 
 
329 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  44.57 
 
 
282 aa  225  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19644  predicted protein  46.84 
 
 
268 aa  225  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00530685  normal  0.519725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1588  methionine aminopeptidase, type I  43.51 
 
 
292 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000312682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2272  methionine aminopeptidase  44.98 
 
 
285 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.888452 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05055  methionine aminopeptidase, type I, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00460)  44.37 
 
 
360 aa  223  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116263  hitchhiker  0.0000000000000474355 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4466  predicted protein  44.13 
 
 
306 aa  223  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16620  methionine aminopeptidase, type I  43.57 
 
 
295 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0147101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13460  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.752514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12160  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 
286 aa  222  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00879026  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4070  methionine aminopeptidase  44.61 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  46.35 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12877  methionine aminopeptidase  44.16 
 
 
285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2125  methionine aminopeptidase, type I  41.96 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  45.6 
 
 
253 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  45.6 
 
 
253 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  45.06 
 
 
265 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2096  methionine aminopeptidase  43.82 
 
 
285 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0670638  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2033  methionine aminopeptidase  43.82 
 
 
285 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.081264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2050  methionine aminopeptidase  43.82 
 
 
285 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1412  methionine aminopeptidase type I  42.6 
 
 
298 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12595  predicted protein  49.36 
 
 
357 aa  218  7.999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1362  methionine aminopeptidase, type I  44.25 
 
 
285 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  44.62 
 
 
265 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1690  methionine aminopeptidase, type I  42.96 
 
 
285 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3317  methionine aminopeptidase, type I  42.24 
 
 
292 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1589  methionine aminopeptidase, type I  42.75 
 
 
303 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1692  methionine aminopeptidase, type I  41.81 
 
 
286 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00462281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  45.42 
 
 
266 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5885  methionine aminopeptidase, type I  44.36 
 
 
285 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 
266 aa  215  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  47.2 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  45.28 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  45.28 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  45.28 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  45.28 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  44.88 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2574  methionine aminopeptidase  43.84 
 
 
282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.900231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2191  methionine aminopeptidase, type I  43.22 
 
 
284 aa  212  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0281618  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  46.03 
 
 
261 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  46.03 
 
 
261 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  44.66 
 
 
265 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  42.06 
 
 
277 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  45.2 
 
 
253 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  45.83 
 
 
260 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  44.49 
 
 
278 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  45.42 
 
 
260 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  42.69 
 
 
265 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  45.75 
 
 
268 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  44.35 
 
 
260 aa  207  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  43.43 
 
 
278 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2038  methionine aminopeptidase, type I  44.93 
 
 
275 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.138159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  43.82 
 
 
265 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  43.43 
 
 
278 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  43.43 
 
 
278 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
268 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
268 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  43.87 
 
 
266 aa  205  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  45.31 
 
 
273 aa  205  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
268 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
266 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  43.98 
 
 
261 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  48.75 
 
 
264 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  42.63 
 
 
265 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  48.75 
 
 
264 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  48.75 
 
 
264 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  48.75 
 
 
264 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  48.75 
 
 
264 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  41.44 
 
 
289 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
255 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_002620  TC0240  methionine aminopeptidase  41.07 
 
 
291 aa  203  3e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 
268 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4322  predicted protein  47.19 
 
 
282 aa  202  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1733  putative methionine aminopeptidase  41.92 
 
 
266 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  44.8 
 
 
262 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  41.06 
 
 
289 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  45.75 
 
 
267 aa  202  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  43.5 
 
 
261 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  42.26 
 
 
280 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  46.67 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  44.13 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  46.67 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  46.67 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  46.67 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  46.67 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>