More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2038 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2038  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.138159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3317  methionine aminopeptidase, type I  76.19 
 
 		 292 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1588  methionine aminopeptidase, type I  72.53 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000312682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1589  methionine aminopeptidase, type I  72.89 
 
 		 303 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  72 
 
 		 283 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12160  methionine aminopeptidase, type I  72.89 
 
 		 286 aa  418  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00879026  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  71.27 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2574  methionine aminopeptidase  70.96 
 
 		 282 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.900231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1319  methionine aminopeptidase, type I  69.85 
 
 		 285 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123772  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  71.22 
 
 		 270 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15230  methionine aminopeptidase, type I  71.43 
 
 		 289 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  72.79 
 
 		 285 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2122  methionine aminopeptidase, type I  75.82 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1412  methionine aminopeptidase type I  69.49 
 
 		 298 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1690  methionine aminopeptidase, type I  69.12 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2191  methionine aminopeptidase, type I  69.85 
 
 		 284 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0281618  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1491  methionine aminopeptidase, type I  67.77 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.717494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13460  methionine aminopeptidase, type I  69.81 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.752514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1362  methionine aminopeptidase, type I  70.59 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2033  methionine aminopeptidase  68.01 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.081264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2096  methionine aminopeptidase  68.01 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0670638  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2272  methionine aminopeptidase  66.91 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10020  methionine aminopeptidase, type I  67.28 
 
 		 285 aa  377  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4070  methionine aminopeptidase  66.91 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2050  methionine aminopeptidase  68.01 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2125  methionine aminopeptidase, type I  67.28 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12877  methionine aminopeptidase  66.67 
 
 		 285 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1692  methionine aminopeptidase, type I  67.28 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00462281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5885  methionine aminopeptidase, type I  66.3 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16620  methionine aminopeptidase, type I  58.09 
 
 		 295 aa  327  9e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0147101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  57.41 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  53.51 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  53.87 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  53.51 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  51.43 
 
 		 261 aa  268  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  51.02 
 
 		 260 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  52.24 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04150  conserved hypothetical protein  48.93 
 
 		 418 aa  260  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  51.84 
 
 		 258 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  51.82 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 		 274 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  48.98 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  51.61 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  51.25 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  48.16 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  48.16 
 
 		 261 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  48.98 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  48.98 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  48.98 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  48.98 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  49.41 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  51.02 
 
 		 260 aa  248  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4466  predicted protein  48.92 
 
 		 306 aa  248  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  52.5 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  50.82 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  49.6 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 264 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 264 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  48.16 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  51.26 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  48.57 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  48.43 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  47.35 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  49.58 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  48.95 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  48.95 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  48.37 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  48.57 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  49.2 
 
 		 265 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  49.79 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  50.39 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>