39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0300 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0300  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 430 aa  882    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.225443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07986  hypothetical protein  23.68 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1069 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  24.72 
 
 		 955 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 466 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 594 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 313 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  23.94 
 
 		 619 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 878 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.06 
 
 		 1737 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 4079 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.6 
 
 		 725 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  21.57 
 
 		 1600 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  24.81 
 
 		 1004 aa  47  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1987  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 891 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.66 
 
 		 610 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 610 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  19.61 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1178 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 		 199 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 221 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.94 
 
 		 730 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.83 
 
 		 810 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  24.89 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  35.06 
 
 		 288 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2662  tetratricopeptide domain-containing protein  27.22 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0513511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2038  TPR domain-containing protein  22.64 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2193  TPR domain-containing protein  22.64 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 4095 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 250 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 762 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  23.93 
 
 		 612 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.86 
 
 		 280 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>