57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2756 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3346  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  100 
 
 
220 aa  430  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407599  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2756  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  100 
 
 
220 aa  430  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4791  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  72.27 
 
 
220 aa  300  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2566  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  73.64 
 
 
220 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  69.09 
 
 
220 aa  285  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1468  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  68.18 
 
 
219 aa  267  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0920919  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3548  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  69.55 
 
 
219 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169533  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1168  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  38.71 
 
 
240 aa  141  8e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.574508  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1706  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  36.36 
 
 
200 aa  118  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1633  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  40 
 
 
200 aa  116  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1406  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.97 
 
 
200 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.84 
 
 
229 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  27.85 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.2 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.5 
 
 
241 aa  58.5  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1675  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.86 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.27 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.02 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.67 
 
 
930 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.53 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.94 
 
 
933 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5101  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.04 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.3 
 
 
933 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0669  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.33 
 
 
155 aa  52.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.95 
 
 
975 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.48 
 
 
932 aa  51.6  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  30.59 
 
 
964 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.28 
 
 
931 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.52 
 
 
983 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25.27 
 
 
331 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.66 
 
 
931 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.57 
 
 
930 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.48 
 
 
992 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.1 
 
 
931 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.91 
 
 
933 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.19 
 
 
984 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.35 
 
 
958 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.19 
 
 
984 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0683  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  27.6 
 
 
258 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.76 
 
 
932 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.14 
 
 
981 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.4 
 
 
997 aa  45.1  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25.93 
 
 
345 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25.71 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  33.9 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.06 
 
 
931 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.46 
 
 
947 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.6 
 
 
971 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.4 
 
 
971 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.16 
 
 
957 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1395  hypothetical protein  30.83 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.8 
 
 
973 aa  42.4  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.21 
 
 
941 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.64 
 
 
971 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.88 
 
 
959 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.83 
 
 
970 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.94 
 
 
971 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>