49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1620 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3346  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  69.09 
 
 
220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407599  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2756  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  69.09 
 
 
220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4791  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  68.18 
 
 
220 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2566  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  68.95 
 
 
220 aa  267  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1468  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  66.36 
 
 
219 aa  262  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0920919  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3548  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  66.82 
 
 
219 aa  247  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169533  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1168  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  38.36 
 
 
240 aa  148  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.574508  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1633  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.55 
 
 
200 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1706  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  40 
 
 
200 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1406  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.15 
 
 
200 aa  105  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  33.83 
 
 
229 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  26.81 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.81 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.69 
 
 
233 aa  61.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.17 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1675  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  26.34 
 
 
253 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  31.72 
 
 
964 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.71 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.73 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0669  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  31.67 
 
 
155 aa  53.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5101  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  25 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30 
 
 
933 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0683  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.8 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.61 
 
 
931 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30 
 
 
933 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.71 
 
 
958 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.97 
 
 
177 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0751622  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.56 
 
 
345 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  35.59 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  33.61 
 
 
948 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.77 
 
 
931 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.55 
 
 
930 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.14 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.82 
 
 
958 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.51 
 
 
933 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.34 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000846498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.48 
 
 
983 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.79 
 
 
932 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.97 
 
 
975 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.12 
 
 
992 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.93 
 
 
961 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  23.03 
 
 
331 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1783  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  28.29 
 
 
253 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.1 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.3 
 
 
957 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1913  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.93 
 
 
935 aa  42  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.88 
 
 
975 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.98 
 
 
981 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>