43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1468 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1468  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0920919  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4791  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  68.18 
 
 		 220 aa  274  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2566  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  71.82 
 
 		 220 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3548  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  72.15 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169533  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2756  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  68.18 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3346  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  68.18 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407599  normal  0.422144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1620  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  66.36 
 
 		 220 aa  261  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1706  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  37.9 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1633  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  37.44 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1168  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  40.53 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.574508  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1406  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.02 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.57 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  27.87 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.16 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.94 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.57 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  26.84 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0669  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.47 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.34 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  26.67 
 
 		 964 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  28.5 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1675  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  27.51 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  32.76 
 
 		 313 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.13 
 
 		 930 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.58 
 
 		 933 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.9 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000846498 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1783  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.77 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1044  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.27 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.92 
 
 		 961 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.03 
 
 		 958 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 948 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.54 
 
 		 931 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.2 
 
 		 938 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.96 
 
 		 943 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.81 
 
 		 932 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.07 
 
 		 969 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.21 
 
 		 345 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  29.75 
 
 		 980 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.13 
 
 		 952 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.77 
 
 		 933 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.36 
 
 		 958 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.65 
 
 		 931 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.97 
 
 		 930 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>