20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4359 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  80.9 
 
 		 534 aa  936    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  80.9 
 
 		 534 aa  934    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  100 
 
 		 534 aa  1118    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  33.33 
 
 		 530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1806  TROVE domain-containing protein  34.28 
 
 		 534 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00385178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  30.59 
 
 		 531 aa  238  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  29.6 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  25.05 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  22.72 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  22.45 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  20.28 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  22.36 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  19.88 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  19.28 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  21.82 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  22.65 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  22.6 
 
 		 509 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7159  TROVE domain protein  21.17 
 
 		 508 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2911  hypothetical protein  21.67 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1232  hypothetical protein  27.06 
 
 		 489 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>