16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3636 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  100 
 
 
531 aa  1050    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  54.41 
 
 
530 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1806  TROVE domain-containing protein  53.61 
 
 
534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00385178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  40.35 
 
 
553 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  31.54 
 
 
534 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  31.54 
 
 
534 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  31.41 
 
 
534 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  23.67 
 
 
515 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  25.89 
 
 
542 aa  70.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  21.84 
 
 
546 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  21.99 
 
 
487 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  24.02 
 
 
517 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  23.62 
 
 
517 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  22.83 
 
 
517 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  25.93 
 
 
509 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  30.08 
 
 
518 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>