18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1806 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1806  TROVE domain-containing protein  100 
 
 		 534 aa  1052    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00385178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  79.17 
 
 		 530 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  53.99 
 
 		 531 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  39.93 
 
 		 553 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  34.28 
 
 		 534 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  34.4 
 
 		 534 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  35.09 
 
 		 534 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  24.61 
 
 		 546 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  24.72 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  24.39 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  24.31 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  23.63 
 
 		 515 aa  57  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  21.68 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  26.2 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  23.3 
 
 		 517 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  26.36 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  23.9 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1232  hypothetical protein  26.72 
 
 		 489 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>