23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1945 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  100 
 
 		 515 aa  1056    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  59.26 
 
 		 517 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  58.87 
 
 		 517 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  58.87 
 
 		 517 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  42.91 
 
 		 542 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  27.76 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  25.05 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  25.09 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7159  TROVE domain protein  26.18 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  25.05 
 
 		 509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  28.51 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  27.96 
 
 		 553 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  22.86 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  23.63 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  20.38 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  20.9 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0322  TROVE domain protein  25.77 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2337  conserved hypothetical protein; putative ribonucleoprotein-related protein  25.85 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0618745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  24.95 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2911  hypothetical protein  27.67 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  23.95 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1232  hypothetical protein  22.97 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3746  hypothetical protein  24.11 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>