24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1146 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1117    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  29.83 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  29.77 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  29.03 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  28.42 
 
 		 542 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  27.76 
 
 		 515 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  27.56 
 
 		 534 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  27.56 
 
 		 534 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  25.05 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  23.68 
 
 		 487 aa  120  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  23.45 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  25.35 
 
 		 509 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  26.04 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  25.86 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7159  TROVE domain protein  23.48 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0322  TROVE domain protein  23.9 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  23.9 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  25.67 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1806  TROVE domain-containing protein  24.82 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00385178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  21.84 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2911  hypothetical protein  23.71 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2337  conserved hypothetical protein; putative ribonucleoprotein-related protein  24.66 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0618745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3746  hypothetical protein  23.09 
 
 		 446 aa  53.9  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1232  hypothetical protein  24.41 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>