21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3828 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  100 
 
 		 517 aa  1062    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  98.65 
 
 		 517 aa  1048    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  97.87 
 
 		 517 aa  1038    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  58.87 
 
 		 515 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  42.99 
 
 		 542 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  29.83 
 
 		 546 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  23.79 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7159  TROVE domain protein  24.06 
 
 		 508 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  23.76 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  23.56 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  25.74 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  20.28 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  21.05 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  21.05 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  23.52 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0322  TROVE domain protein  22.74 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  24.86 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  24.02 
 
 		 531 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  25.93 
 
 		 530 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2337  conserved hypothetical protein; putative ribonucleoprotein-related protein  23.94 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0618745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1806  TROVE domain-containing protein  23.84 
 
 		 534 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00385178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>