17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7219 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1806  TROVE domain-containing protein  79.17 
 
 		 534 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00385178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7219  TROVE domain protein  100 
 
 		 530 aa  1038    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  54.22 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  38.91 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  34.83 
 
 		 534 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  34.83 
 
 		 534 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  25.37 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  25.32 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  25.95 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  25.57 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  23.61 
 
 		 487 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  24.51 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  25.76 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  23.6 
 
 		 542 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  28.16 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  25.78 
 
 		 500 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>