20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0506 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  100 
 
 		 542 aa  1112    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  42.99 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  43.17 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3891  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  42.8 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  42.91 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  28.42 
 
 		 546 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7159  TROVE domain protein  25.1 
 
 		 508 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  25.09 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  24.29 
 
 		 526 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7011  hypothetical protein  27.59 
 
 		 553 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140564  hitchhiker  0.00365141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  24.76 
 
 		 509 aa  90.1  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  27.48 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  23.76 
 
 		 500 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  22.78 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  22.78 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0322  TROVE domain protein  24.13 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3636  TROVE domain protein  25.57 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  21.82 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1806  TROVE domain-containing protein  23.86 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00385178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1232  hypothetical protein  20.91 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>