19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1232 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  972    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.891073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3368  hypothetical protein  35.88 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2764  TROVE domain-containing protein  23.06 
 
 		 487 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0322  TROVE domain protein  25.24 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0813  TROVE domain protein  26.71 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2911  hypothetical protein  28.41 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2908  ribonucleoprotein-like  24.17 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2337  conserved hypothetical protein; putative ribonucleoprotein-related protein  26.91 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0618745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1146  TROVE domain-containing protein  24.41 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7159  TROVE domain protein  24.7 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0085  TROVE domain protein  25.41 
 
 		 526 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1945  TROVE  24.38 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0506  TROVE domain protein  20.71 
 
 		 542 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3721  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  27.16 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3828  60-kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein  27.16 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.65682  normal  0.624732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4359  TROVE domain protein  26.69 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3906  TROVE domain protein  23.8 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3958  TROVE domain protein  23.8 
 
 		 534 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00101177  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3746  hypothetical protein  27.97 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>