More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  98.81 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  81.93 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  82.33 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  77.04 
 
 		 265 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  76.65 
 
 		 256 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  76.77 
 
 		 256 aa  357  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  76.77 
 
 		 256 aa  357  7e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  75.79 
 
 		 252 aa  354  8.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  73.91 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  74.9 
 
 		 248 aa  340  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  64.54 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  64.11 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  62.15 
 
 		 251 aa  291  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  61.13 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  61.85 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  62 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  59.68 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  59.68 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  60.89 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  64.4 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  58.3 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  58 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  58.05 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  57.26 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  60.64 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  58.09 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  57.14 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  59.92 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  59.5 
 
 		 238 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  61.79 
 
 		 245 aa  272  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  58.26 
 
 		 239 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 250 aa  271  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  59.58 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  55.04 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  58.87 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  57.14 
 
 		 249 aa  264  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  60.33 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  63.71 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  63.16 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  61.75 
 
 		 249 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  60.48 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  59.75 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  54.8 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  54.69 
 
 		 295 aa  255  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  55.65 
 
 		 244 aa  254  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  61.83 
 
 		 254 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  52.17 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  56.58 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  58.82 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  61.23 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  51.21 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  60.53 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  57.26 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  60.49 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  55.98 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  55.98 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  54.25 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  56.58 
 
 		 240 aa  245  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1356  integral membrane protein TerC  58.4 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  54.18 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  51.44 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  46.8 
 
 		 514 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  47.93 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5872  Integral membrane protein TerC  54.98 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000565064  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  47.18 
 
 		 518 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.2 
 
 		 519 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.2 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  47.2 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.2 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 528 aa  234  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  47.2 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  48.98 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  48.98 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.8 
 
 		 516 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  48.98 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.8 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  46.99 
 
 		 523 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  48.98 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>