More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4909 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  59.66 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  56.9 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  60.17 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  57.72 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  57.08 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  55.41 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  60.52 
 
 		 253 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  60.52 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  55.41 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  60.52 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  52.5 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  57.02 
 
 		 249 aa  254  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  57.61 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  59.39 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  59.59 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  57.85 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  59.39 
 
 		 256 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  55.16 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  57.02 
 
 		 259 aa  248  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  53.09 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  54.7 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  56.47 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  56.14 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  55.83 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  55.17 
 
 		 250 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  57.87 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  57.21 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  52.74 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  55.84 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  56.33 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  55.46 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  56.19 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  55.02 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  50.85 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  54.27 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  55.46 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  56.58 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  51.71 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  57.02 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  52.56 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  50.62 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  57.02 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  51.85 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  55.02 
 
 		 241 aa  232  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  52.84 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  50.84 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  51.87 
 
 		 251 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  51.97 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  50 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1356  integral membrane protein TerC  52.48 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  50.42 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  53.02 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  52.61 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  53.72 
 
 		 249 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  49.35 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  50.41 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  52.4 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  53.39 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2631  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.124087  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  53.59 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  48.9 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  46.52 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  52.36 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.33 
 
 		 519 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  53.51 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  49.32 
 
 		 510 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.33 
 
 		 519 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  53.51 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  53.51 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  49.33 
 
 		 519 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  53.51 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.33 
 
 		 519 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  49.33 
 
 		 519 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  53.51 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  47.54 
 
 		 518 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  53.02 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  49.78 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5872  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000565064  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  50.85 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  49.55 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  49.57 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  51.1 
 
 		 518 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  53.07 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>