More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3200 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  89.83 
 
 
238 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  91.06 
 
 
238 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  85.71 
 
 
238 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  82.91 
 
 
237 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  82.91 
 
 
237 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  82.91 
 
 
237 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  82.91 
 
 
237 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  82.91 
 
 
237 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  82.48 
 
 
237 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  58.65 
 
 
248 aa  293  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  58.75 
 
 
250 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  56.78 
 
 
259 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  58.47 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  59.24 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  57.45 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  55.83 
 
 
241 aa  267  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  56.36 
 
 
250 aa  265  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  57.14 
 
 
247 aa  265  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  55.93 
 
 
241 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  57.63 
 
 
251 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 
255 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  55.08 
 
 
238 aa  260  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  60.09 
 
 
241 aa  258  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  54.01 
 
 
252 aa  257  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
250 aa  257  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  58.9 
 
 
250 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  56.02 
 
 
253 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  56.07 
 
 
254 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  52.92 
 
 
246 aa  254  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  53.14 
 
 
239 aa  254  9e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  55.65 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  58.55 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 
250 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 
250 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  52.12 
 
 
518 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  55.88 
 
 
256 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  55.2 
 
 
245 aa  251  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  55 
 
 
255 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  55.65 
 
 
256 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  55.97 
 
 
256 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  59.91 
 
 
253 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  51.69 
 
 
522 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  48.95 
 
 
254 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  52.14 
 
 
243 aa  248  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
250 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  50.66 
 
 
577 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  58.4 
 
 
256 aa  248  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  49.78 
 
 
528 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  58.23 
 
 
245 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  55.65 
 
 
253 aa  248  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  56.3 
 
 
265 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
518 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
249 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  59.57 
 
 
244 aa  245  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
252 aa  244  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.54 
 
 
523 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  56.17 
 
 
295 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  49.38 
 
 
523 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  49.38 
 
 
523 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  49.17 
 
 
522 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  52.07 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  58.08 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  52.97 
 
 
522 aa  241  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  56.49 
 
 
248 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  55.88 
 
 
253 aa  241  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
249 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  48.97 
 
 
523 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  56.14 
 
 
258 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  55.87 
 
 
264 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  48.02 
 
 
529 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  56.49 
 
 
254 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  55.7 
 
 
249 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  47.92 
 
 
522 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  50 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  49.58 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  58.4 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
251 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  58.82 
 
 
252 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  50.66 
 
 
274 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  48.13 
 
 
249 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  51.54 
 
 
530 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  54.62 
 
 
253 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  54.62 
 
 
253 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  50.42 
 
 
515 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  50 
 
 
271 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  54.2 
 
 
253 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  49.37 
 
 
261 aa  234  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  47.58 
 
 
529 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  55.33 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.377991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>