264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1356 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1356  integral membrane protein TerC  100 
 
 
255 aa  501  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  58.33 
 
 
248 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  58.44 
 
 
252 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  56.56 
 
 
259 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  55.37 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  57.61 
 
 
248 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  53.82 
 
 
254 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  59.27 
 
 
254 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  52.99 
 
 
253 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  54.69 
 
 
249 aa  254  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  55.42 
 
 
238 aa  255  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  54 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  53.85 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  56.33 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  52.89 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  53.72 
 
 
248 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  54.17 
 
 
238 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  54.92 
 
 
256 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  54.51 
 
 
250 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  54.29 
 
 
256 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  51.85 
 
 
239 aa  248  6e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  54.51 
 
 
265 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  48.02 
 
 
249 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  48.22 
 
 
250 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  54.62 
 
 
251 aa  246  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 
250 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  54.96 
 
 
253 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  48.22 
 
 
250 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 
247 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  52.96 
 
 
250 aa  245  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  52.67 
 
 
253 aa  244  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  47.43 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  51.63 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  51.25 
 
 
238 aa  242  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  49.41 
 
 
251 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  51.63 
 
 
241 aa  241  7e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  53.88 
 
 
253 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  53.47 
 
 
253 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  53.47 
 
 
253 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  57.2 
 
 
249 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  50.62 
 
 
241 aa  238  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  56.49 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  52.87 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  55.1 
 
 
254 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  54.32 
 
 
238 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  52.87 
 
 
250 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  47.62 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  51.45 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  52.24 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
238 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  48.96 
 
 
271 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  47.37 
 
 
247 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  58.4 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  54.73 
 
 
237 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  54.73 
 
 
237 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  54.73 
 
 
237 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  54.73 
 
 
237 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  57.14 
 
 
252 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  54.73 
 
 
237 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  48.77 
 
 
250 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  51.67 
 
 
257 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  53.33 
 
 
245 aa  229  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  47.62 
 
 
251 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  52.24 
 
 
250 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  49.61 
 
 
251 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.56 
 
 
519 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  48.56 
 
 
519 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.56 
 
 
519 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  48.56 
 
 
519 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.56 
 
 
519 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  54.32 
 
 
237 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  54.36 
 
 
295 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  48.58 
 
 
253 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
253 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  51.18 
 
 
264 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  46.96 
 
 
251 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  46.96 
 
 
251 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  49.38 
 
 
250 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  50.62 
 
 
251 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  50.62 
 
 
251 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  50.62 
 
 
251 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  45.67 
 
 
518 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  46.47 
 
 
274 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  47.5 
 
 
514 aa  224  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  45.56 
 
 
518 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  55.42 
 
 
249 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  48.8 
 
 
247 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  48.4 
 
 
247 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  47.06 
 
 
253 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  55.83 
 
 
251 aa  222  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  53.33 
 
 
253 aa  222  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>