More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1293 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01969  fused predicted membrane protein/predicted membrane protein  69.75 
 
 		 527 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1169  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  69.75 
 
 		 527 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1594  Integral membrane protein TerC  69.94 
 
 		 527 aa  727    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  75.43 
 
 		 529 aa  809    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 528 aa  1072    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  73.91 
 
 		 529 aa  768    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2450  CBS domain-containing protein  74.62 
 
 		 528 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.889017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0999  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  69.94 
 
 		 527 aa  727    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1578  integral membrane protein TerC  69.94 
 
 		 527 aa  727    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  94.51 
 
 		 577 aa  1012    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2549  integral membrane protein TerC  74.62 
 
 		 528 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.584861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  74.05 
 
 		 528 aa  789    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2356  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  69.75 
 
 		 527 aa  725    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2998  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  69.75 
 
 		 527 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.159646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3192  CBS domain-containing protein  74.62 
 
 		 528 aa  792    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237895  hitchhiker  0.00326333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  68.24 
 
 		 527 aa  734    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01958  hypothetical protein  69.75 
 
 		 527 aa  725    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  52.2 
 
 		 523 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  52.01 
 
 		 523 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  51.43 
 
 		 523 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  52.02 
 
 		 523 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50.87 
 
 		 518 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  53.07 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  48.47 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  48.93 
 
 		 522 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  52.26 
 
 		 515 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  53.23 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  48.87 
 
 		 518 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  48.87 
 
 		 522 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  50.57 
 
 		 522 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  48.48 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  49.14 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  48.22 
 
 		 518 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.21 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.4 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  50.48 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.4 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  48.4 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  48.4 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  49.33 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.2 
 
 		 516 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  48.68 
 
 		 517 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  45.86 
 
 		 530 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.65 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2870  integral membrane protein TerC  48.84 
 
 		 522 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  48.75 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1066  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  48.75 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  48.75 
 
 		 522 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  44.12 
 
 		 510 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3379  integral membrane protein TerC  46.53 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0880  integral membrane protein  44.15 
 
 		 527 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000917875  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05062  hypothetical protein  46.64 
 
 		 526 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  43.89 
 
 		 518 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4207  Integral membrane protein TerC  46.59 
 
 		 526 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4317  Integral membrane protein TerC  46.59 
 
 		 526 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.67976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0348  Integral membrane protein TerC  40.66 
 
 		 527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0452  TerC family membrane protein  38.85 
 
 		 444 aa  287  4e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.789805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.49 
 
 		 254 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  53.95 
 
 		 250 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  54.39 
 
 		 248 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  51.06 
 
 		 251 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  53.95 
 
 		 250 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  51.68 
 
 		 239 aa  252  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  51.77 
 
 		 238 aa  249  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  54.66 
 
 		 255 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 249 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  50.88 
 
 		 271 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  51.52 
 
 		 250 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  51.08 
 
 		 250 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  51.08 
 
 		 250 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  54.82 
 
 		 257 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  53.16 
 
 		 247 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  54.82 
 
 		 250 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  51.08 
 
 		 250 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 251 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 251 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 243 aa  243  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  51.06 
 
 		 247 aa  243  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  51.75 
 
 		 251 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 253 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  51.75 
 
 		 267 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  53.07 
 
 		 259 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 253 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  51.33 
 
 		 251 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  49.34 
 
 		 238 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  55.26 
 
 		 253 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  53.3 
 
 		 238 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  50.4 
 
 		 250 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  48.99 
 
 		 248 aa  240  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 255 aa  240  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  54.01 
 
 		 295 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  50.88 
 
 		 252 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>