More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2706 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  65.06 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  68.68 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  65.43 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  65.43 
 
 		 250 aa  319  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  70.16 
 
 		 295 aa  317  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  63.07 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  61.22 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  65.43 
 
 		 245 aa  308  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  64.11 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  57.71 
 
 		 259 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  68.6 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  65.43 
 
 		 253 aa  301  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  60.33 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  60 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  67.76 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  58.2 
 
 		 250 aa  298  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  61.9 
 
 		 250 aa  298  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  61.97 
 
 		 241 aa  298  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  60 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  62.34 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  59.22 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  58.47 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  59.75 
 
 		 251 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  59.24 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  65.16 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  60 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  62.07 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  59.57 
 
 		 246 aa  285  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  61.98 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  61.98 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  61.98 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  59.4 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  64.5 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  60.08 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  57.89 
 
 		 518 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  57.03 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  54.1 
 
 		 523 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  59.68 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  61.6 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  59.07 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  59.65 
 
 		 530 aa  271  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  62 
 
 		 252 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  53.69 
 
 		 523 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  53.69 
 
 		 523 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  55.7 
 
 		 518 aa  271  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  54 
 
 		 522 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  61.84 
 
 		 519 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  61.84 
 
 		 519 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  61.84 
 
 		 519 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  61.84 
 
 		 519 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  61.84 
 
 		 519 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  62.3 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  54.66 
 
 		 528 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  56.18 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  55.06 
 
 		 577 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  54.1 
 
 		 518 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  55.27 
 
 		 522 aa  268  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  60.96 
 
 		 518 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  60.96 
 
 		 516 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  53.28 
 
 		 523 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  53.2 
 
 		 522 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  59.27 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  55.78 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  56 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  60.17 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  57.2 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  60.33 
 
 		 249 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  57.02 
 
 		 527 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  56.18 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  56.58 
 
 		 529 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  57.43 
 
 		 252 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  55.38 
 
 		 265 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  58.33 
 
 		 518 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  56.68 
 
 		 518 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  56.14 
 
 		 529 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  60.93 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2450  CBS domain-containing protein  58.33 
 
 		 528 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.889017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  57.09 
 
 		 510 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  58.77 
 
 		 514 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  61.47 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  57.03 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  56.79 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  59.21 
 
 		 528 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  54.51 
 
 		 515 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>