290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1725 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 268 aa  530  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  69.58 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  62.75 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  66.14 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  62.4 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  60.32 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  58.61 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  61.18 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  55.34 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  56.08 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  56.4 
 
 		 259 aa  274  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  63.01 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  59.44 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  55 
 
 		 250 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  60.56 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  53.88 
 
 		 252 aa  271  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  58.13 
 
 		 250 aa  271  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  55.42 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  59.44 
 
 		 239 aa  269  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  58.73 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  56.03 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  54.15 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  61.04 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  57.09 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  55.23 
 
 		 241 aa  258  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  58.3 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  56.33 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  59.84 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  56.68 
 
 		 246 aa  254  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  59.59 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  55.79 
 
 		 241 aa  251  7e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  54.51 
 
 		 514 aa  251  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  57.83 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  57.03 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  56.22 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  56.22 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  52.78 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  55.47 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  57.66 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  53.88 
 
 		 518 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  55.1 
 
 		 238 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  51.78 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  52.73 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  53.17 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  50.81 
 
 		 523 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  56.3 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  50.41 
 
 		 523 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  50.41 
 
 		 523 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  53.91 
 
 		 519 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  53.91 
 
 		 519 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  53.91 
 
 		 519 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  53.91 
 
 		 519 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  53.91 
 
 		 519 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2157  Integral membrane protein TerC  55.16 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  49.19 
 
 		 523 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  52.03 
 
 		 516 aa  238  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  54.59 
 
 		 518 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  58.73 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  53.06 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  53.91 
 
 		 530 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  52.87 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  52.7 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  52.87 
 
 		 517 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  49.8 
 
 		 522 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  53.06 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1231  Integral membrane protein TerC  49.07 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  54.72 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  49.39 
 
 		 522 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  53.04 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 		 518 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  51.6 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  50.38 
 
 		 265 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  49.8 
 
 		 518 aa  231  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  46.83 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  49.8 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  55.65 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  55.65 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  55.65 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  55.65 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  55.65 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  55.65 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  54.73 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  53.07 
 
 		 528 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1627  Integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  51.84 
 
 		 517 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  52.48 
 
 		 518 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  49.81 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  54.44 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  54.39 
 
 		 577 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>