More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0032 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  90.62 
 
 		 256 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  88.28 
 
 		 256 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  87.11 
 
 		 265 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  87.11 
 
 		 256 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  81.18 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  82.35 
 
 		 248 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  82.75 
 
 		 254 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  70.47 
 
 		 252 aa  338  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  74.7 
 
 		 252 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  73.91 
 
 		 252 aa  329  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  59.29 
 
 		 248 aa  298  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  58.1 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  58.33 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  56.3 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  57.85 
 
 		 238 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  58.4 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  55.78 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  54.34 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  54.98 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  58.1 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  55.92 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  57.55 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  55.08 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  57.61 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  56.8 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  55.97 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  55.06 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  59.39 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  54.98 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 253 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  54.22 
 
 		 250 aa  261  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  56 
 
 		 255 aa  261  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  52.21 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  54.1 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  53.93 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  55.13 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  55.69 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  56.3 
 
 		 253 aa  254  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  56.63 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  53.75 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  50.8 
 
 		 250 aa  248  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1356  integral membrane protein TerC  55.04 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  57.48 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  54.1 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  54.1 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  54.1 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  54.1 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  54.1 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  54.47 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  58.17 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  54.8 
 
 		 245 aa  244  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  49.58 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  55 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  55.83 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  48.97 
 
 		 249 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 249 aa  241  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  47.2 
 
 		 242 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  52.46 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  55.36 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  55.69 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  51 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  50.81 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  50.4 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  47.44 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  46.94 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  46.53 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  52.87 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  45.42 
 
 		 523 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  46.53 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  47.01 
 
 		 518 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  52.76 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1627  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  45.02 
 
 		 523 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  45.02 
 
 		 523 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  46.43 
 
 		 518 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.43 
 
 		 516 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  46.12 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  46.47 
 
 		 527 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  46.56 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>