More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1601 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  64.78 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  61.6 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  62.29 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  62.65 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  60 
 
 		 238 aa  289  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  61.44 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  58.8 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  60.43 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  57.26 
 
 		 251 aa  278  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  58.2 
 
 		 253 aa  278  7e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  56.07 
 
 		 248 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  60.09 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  57.98 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  61.28 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  58.51 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  62.45 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  62.45 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  60.41 
 
 		 249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  59.29 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  62.07 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  57.79 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  59.92 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  51.76 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  55.42 
 
 		 253 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  60.43 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  62.66 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  55.6 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  51.84 
 
 		 522 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  57.68 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  49.6 
 
 		 523 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  49.19 
 
 		 523 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  49.19 
 
 		 523 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  49.19 
 
 		 523 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  57.14 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  51.43 
 
 		 522 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 		 518 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  60.32 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  58.37 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  55.42 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  54.47 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  57.32 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  57.5 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  56.6 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  55.13 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  51.64 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  51.64 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.6 
 
 		 516 aa  248  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.6 
 
 		 518 aa  248  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  51.23 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  248  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  56.36 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  52.87 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  51.64 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  54.22 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  49.58 
 
 		 522 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  52.05 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  53.72 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  50.6 
 
 		 510 aa  244  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  54.13 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  54 
 
 		 252 aa  243  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.4 
 
 		 519 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.4 
 
 		 519 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  51.91 
 
 		 518 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  54.89 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  49.4 
 
 		 519 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  49.4 
 
 		 519 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.4 
 
 		 519 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  59.05 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  55.07 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  49.61 
 
 		 518 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  51.98 
 
 		 518 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  52.78 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  51.79 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  46.8 
 
 		 577 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  54.08 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  56.17 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  56.41 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  56.17 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  50.85 
 
 		 514 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  56.17 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  56.17 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  56.17 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  51.39 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  46.8 
 
 		 528 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  53.2 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  54.07 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  50.64 
 
 		 530 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  50.64 
 
 		 515 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>