289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0786 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  84 
 
 
250 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  84.43 
 
 
250 aa  400  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  84 
 
 
257 aa  394  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  78.78 
 
 
248 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  77.96 
 
 
245 aa  353  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  63.11 
 
 
259 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  65.43 
 
 
255 aa  300  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  66.67 
 
 
244 aa  300  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  64.26 
 
 
259 aa  298  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  61.07 
 
 
252 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  65.43 
 
 
253 aa  297  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  62.82 
 
 
241 aa  292  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  63.79 
 
 
247 aa  291  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  57.66 
 
 
249 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  57.2 
 
 
250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  59.02 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  58.89 
 
 
253 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  61.54 
 
 
239 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  58.23 
 
 
250 aa  281  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  58.5 
 
 
251 aa  280  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  57.85 
 
 
253 aa  277  9e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  60.47 
 
 
295 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  60.32 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  60.78 
 
 
238 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  60.56 
 
 
268 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  59.23 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  58.7 
 
 
238 aa  268  5e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  56.35 
 
 
248 aa  268  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  58.37 
 
 
250 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  59.47 
 
 
264 aa  267  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  60.57 
 
 
258 aa  267  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  61.16 
 
 
253 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  62.34 
 
 
241 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  61.16 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  57.94 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  58.05 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  57.63 
 
 
265 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  58.05 
 
 
256 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  57.26 
 
 
246 aa  263  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  58.8 
 
 
253 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 
253 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  62.4 
 
 
249 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  57.94 
 
 
256 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  62.4 
 
 
248 aa  259  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  58.05 
 
 
238 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  59.23 
 
 
254 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  55.26 
 
 
528 aa  255  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  56.9 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  59.5 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  56.14 
 
 
529 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  54.82 
 
 
577 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  60.58 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  52.16 
 
 
242 aa  251  8.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  55.27 
 
 
249 aa  250  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  53.85 
 
 
518 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  59.91 
 
 
238 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  58.97 
 
 
237 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  51.04 
 
 
518 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  54.82 
 
 
529 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  52.67 
 
 
514 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  58.54 
 
 
254 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  58.51 
 
 
251 aa  248  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  59.53 
 
 
245 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  49.39 
 
 
523 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  49.39 
 
 
523 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  49.39 
 
 
523 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  53.42 
 
 
522 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  55.82 
 
 
252 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 
523 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  54.11 
 
 
251 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  53.85 
 
 
530 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  59.66 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  59.75 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  54.11 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  53.95 
 
 
527 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.23 
 
 
519 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  51.23 
 
 
519 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.23 
 
 
519 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  51.23 
 
 
519 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  57.76 
 
 
238 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.23 
 
 
519 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  57.02 
 
 
528 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
518 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
518 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 
516 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 
518 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>