31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52130 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4572  hypothetical protein  76.98 
 
 		 455 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52130  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  881    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.986693  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.86 
 
 		 365 aa  117  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  23.04 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  27.03 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1368  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 347 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  41.38 
 
 		 726 aa  50.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 737 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.06 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  36.67 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  44.83 
 
 		 751 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  26.5 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  46.3 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  39.58 
 
 		 745 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  39.58 
 
 		 745 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  39.58 
 
 		 745 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  44.68 
 
 		 764 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  23.21 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  36.84 
 
 		 328 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  41.82 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1969  O-antigen chain length regulator  30 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  39.22 
 
 		 747 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>