20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4572 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_52130  hypothetical protein  76.98 
 
 		 442 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.986693  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4572  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  912    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  27.12 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  23.17 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  42.62 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  25.63 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  25.63 
 
 		 326 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  25.63 
 
 		 327 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 326 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  27.59 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1368  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 347 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  41.3 
 
 		 757 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  44.68 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  26.05 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  38.6 
 
 		 487 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  51.35 
 
 		 280 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  26.11 
 
 		 344 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1969  O-antigen chain length regulator  35.21 
 
 		 349 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.64 
 
 		 332 aa  43.1  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>