92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12261 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_12261  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1109  50S ribosomal protein L36  84.21 
 
 		 38 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0865  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  55.26 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  50.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1169  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.406968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  60.53 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1638  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2527  50S ribosomal protein L36P  63.41 
 
 		 41 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0071  50S ribosomal protein L36  60 
 
 		 40 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.484433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 39 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3409  ribosomal protein L36  55 
 
 		 40 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0055  ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28444  mitochondrial ribosomal L36 protein  52.63 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0515598  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3254  50S ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 40 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0284  50S ribosomal protein L36  52.5 
 
 		 40 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30024  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2551  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1686  50S ribosomal protein L36  48.78 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  50 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0656  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 42 aa  42.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.98092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0384  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 42 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.798152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1746  50S ribosomal protein L36  48.78 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1421  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1167  50S ribosomal protein L36  48.78 
 
 		 41 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5959  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36460  LSU ribosomal protein L36P  55 
 
 		 40 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 41 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5210  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.10421  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_002620  TC0169  50S ribosomal protein L36  58.97 
 
 		 45 aa  41.6  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0057232  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  47.37 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1786  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3258  50S ribosomal protein L36P  46.34 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.665984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3686  50S ribosomal protein L36  46.34 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2968  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387293  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2863  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0131  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.609052  normal  0.221368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2741  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.759757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3575  50S ribosomal protein L36  46.34 
 
 		 41 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  50 
 
 		 37 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3630  ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 41 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4677  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3276  50S ribosomal protein L36  46.34 
 
 		 41 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476981  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 37 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1418  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3651  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 49 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128115  normal  0.260738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3273  50S ribosomal protein L36  48.78 
 
 		 41 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2467  50S ribosomal protein L36P  51.22 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  47.37 
 
 		 38 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  47.37 
 
 		 38 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0110  ribosomal protein L36  55 
 
 		 41 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.101674  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 37 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  47.37 
 
 		 38 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>