192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1638 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1638  ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  92.11 
 
 		 38 aa  70.1  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  84.21 
 
 		 38 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  84.21 
 
 		 38 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1169  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  63.9  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.406968  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0865  ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1540  ribosomal protein L36  67.65 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000114042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2467  50S ribosomal protein L36P  63.41 
 
 		 58 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1109  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0384  50S ribosomal protein L36  72.73 
 
 		 42 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.798152  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0055  ribosomal protein L36  66.67 
 
 		 41 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0656  50S ribosomal protein L36  69.7 
 
 		 42 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.98092  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12261  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1421  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 41 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  60.53 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0873  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0110  ribosomal protein L36  68.75 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.101674  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1270  ribosomal protein L36  65.62 
 
 		 41 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2206  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124875  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2400  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000387542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 39 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  63.16 
 
 		 37 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  52.63 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2527  50S ribosomal protein L36P  53.66 
 
 		 41 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2551  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1686  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1746  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3630  ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  60.53 
 
 		 37 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1288  50S ribosomal protein L36  65.62 
 
 		 41 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  hitchhiker  0.0037053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00889  50S ribosomal protein L36  65.62 
 
 		 41 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0343443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3575  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1644  50S ribosomal protein L36  65.62 
 
 		 41 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1124  ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202037  unclonable  0.0000000081945 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3211  50S ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 47 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000339117  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1599  50S ribosomal protein L36  62.5 
 
 		 41 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3032  50S ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 47 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000460301  normal  0.141491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0935  50S ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 46 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.736932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3070  50S ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 47 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2983300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3651  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 49 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128115  normal  0.260738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3997  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3686  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 41 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3276  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476981  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  60.53 
 
 		 37 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1167  50S ribosomal protein L36  54.55 
 
 		 41 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0387  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0514  50S ribosomal protein L36  64.52 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0573  50S ribosomal protein L36  64.52 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000869991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0530  50S ribosomal protein L36  64.52 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000172087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0511  50S ribosomal protein L36  64.52 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190664  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0323  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000213214  normal  0.0994232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0341  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000793538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0071  50S ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 40 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.484433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0349  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0306  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  50 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>