247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28444 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28444  mitochondrial ribosomal L36 protein  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0515598  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  70 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  60 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  57.89 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 39 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1213  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  50.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1844  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  57.89 
 
 		 39 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0479  50S ribosomal protein L36P  63.16 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  63.16 
 
 		 37 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.4  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000000809318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000256453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259477  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.6  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000431262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000628641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000370464  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  60.53 
 
 		 37 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  54.76 
 
 		 41 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000290625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000396935  unclonable  4.5390900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000041135  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  46.6  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  60.53 
 
 		 37 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0589  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4483  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0323  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0249  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  54.05 
 
 		 38 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  52.63 
 
 		 39 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 46 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  57.89 
 
 		 37 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  57.89 
 
 		 37 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>