278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0977 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  92.11 
 
 		 38 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  92.11 
 
 		 38 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2400  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000387542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2206  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 39 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  68.42 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  55.26 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  63.16 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  63.16 
 
 		 39 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4003  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000226529  hitchhiker  0.0000138674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0783  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000359865  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 46 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  57.89 
 
 		 39 aa  50.8  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  50.1  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0865  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234979  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28444  mitochondrial ribosomal L36 protein  57.89 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0515598  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 41 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2435  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 55 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 46 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0673  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 46 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 46 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>