233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1858 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  100 
 
 
38 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  62.16 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  64.86 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
46 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
46 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
46 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 
38 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4003  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000226529  hitchhiker  0.0000138674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  62.16 
 
 
41 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  67.57 
 
 
37 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 
38 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  56.76 
 
 
38 aa  49.7  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 
38 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 
38 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  56.76 
 
 
38 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 
37 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  67.57 
 
 
38 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  56.76 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2206  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 
38 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2400  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 
38 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000387542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
37 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  62.16 
 
 
37 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
38 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1638  ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4616  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  62.16 
 
 
37 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  59.46 
 
 
37 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
38 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  62.16 
 
 
43 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  56.76 
 
 
38 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  62.16 
 
 
38 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0323  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
37 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
39 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
37 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 
37 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 
37 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  64.86 
 
 
37 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0341  50S ribosomal protein L36P  59.46 
 
 
37 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000597452  unclonable  0.0000000332549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  59.46 
 
 
37 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  56.76 
 
 
41 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  54.05 
 
 
38 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>