248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0724 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  100 
 
 		 37 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  63.5  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 		 41 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 46 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000396935  unclonable  4.5390900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000000809318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000370464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000290625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000256453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000628641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000041135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0239  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  0.00000401292 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3305  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001537 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0956  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2435  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3971  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0510  50S ribosomal protein L36  75 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2148  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0657747  normal  0.398863 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0289  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  4.62447e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 43 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2308  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0310  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.696988  normal  0.327601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5049  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0337  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0783  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000359865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0219  LSU ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0622  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0191  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 48 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000986324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  67.57 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0179  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0252  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0341  50S ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000597452  unclonable  0.0000000332549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0217  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000098301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0220  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000362841  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0215  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000134125  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0479  50S ribosomal protein L36P  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0220  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000946708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  62.16 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4035  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000035995  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>