228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2206 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2400  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000387542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2206  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  97.37 
 
 		 38 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  94.74 
 
 		 38 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  94.74 
 
 		 38 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  92.11 
 
 		 38 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 39 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  55.26 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  60.53 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  57.89 
 
 		 39 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4003  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000226529  hitchhiker  0.0000138674 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  55.26 
 
 		 39 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 41 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  48.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1500  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  63.16 
 
 		 37 aa  47.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0274  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  52.63 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0673  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2435  50S ribosomal protein L36P  60.53 
 
 		 37 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 46 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 46 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 46 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  60.53 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2308  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000112956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 46 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>