259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1159 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  100 
 
 
41 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
38 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
38 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  76.32 
 
 
39 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4003  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000226529  hitchhiker  0.0000138674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
39 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  59.3  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  58.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1109  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13498  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103834  normal  0.841805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1126  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.384917  normal  0.806869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1432  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.846939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1138  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.353832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23560  LSU ribosomal protein L36P  73.68 
 
 
37 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
46 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0219  LSU ribosomal protein L36P  73.68 
 
 
38 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2435  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  71.05 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  65.79 
 
 
39 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0239  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  55.26 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
46 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000000809318  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259477  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  55.1  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000041135  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000396935  unclonable  4.5390900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000370464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000256453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000628641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
46 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
46 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000290625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>