241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4003 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4003  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000226529  hitchhiker  0.0000138674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  97.37 
 
 		 38 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  89.47 
 
 		 38 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 41 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 46 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 46 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 46 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 		 39 aa  54.3  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.5  0.0000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  73.68 
 
 		 37 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  59.46 
 
 		 38 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 39 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2206  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2400  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000387542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0622  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0139923  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  60.53 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  52.63 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 43 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0510  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  68.42 
 
 		 37 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>