260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0739 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  100 
 
 
37 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1500  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
43 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5049  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  81.08 
 
 
37 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  83.78 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
41 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  57.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
41 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  0.00000401292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0310  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.696988  normal  0.327601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 
37 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0239  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0783  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000359865  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0394  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
38 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
46 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0402  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000290625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000000809318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3305  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000256453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000396935  unclonable  4.5390900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000370464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0956  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
55 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0191  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
48 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000986324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000628641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0622  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000041135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2148  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0657747  normal  0.398863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4669  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000672096  unclonable  0.00000000651208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0479  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0234  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000243083  unclonable  0.00000771527 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  54.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>