263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17201 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  100 
 
 
38 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  89.47 
 
 
38 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  92.11 
 
 
37 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  78.95 
 
 
39 aa  65.5  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  86.84 
 
 
37 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  86.84 
 
 
37 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
39 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  73.68 
 
 
39 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  84.21 
 
 
37 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  84.21 
 
 
37 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  78.95 
 
 
37 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  61.2  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  78.95 
 
 
37 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.8  0.000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4290  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.856971  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1138  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.353832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1109  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1126  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.384917  normal  0.806869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1432  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.846939  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3899  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4294  ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13498  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103834  normal  0.841805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0589  50S ribosomal protein L36  84.21 
 
 
37 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314897  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  71.05 
 
 
41 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000129575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0673  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  60.53 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  65.79 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1844  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1213  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4483  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0274  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.4  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1114  LSU ribosomal protein L36P  78.95 
 
 
37 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323838  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0960  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0606  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29490  LSU ribosomal protein L36P  78.95 
 
 
37 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144849  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0651  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0712  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6587  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0330  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121743  decreased coverage  0.000353679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23560  LSU ribosomal protein L36P  73.68 
 
 
37 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5149  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.982294  normal  0.58314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1168  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  71.05 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0610  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675982  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3116  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 
38 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  73.68 
 
 
41 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2629  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  76.32 
 
 
41 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20630  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0927005  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04220  LSU ribosomal protein L36P  71.05 
 
 
37 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0267  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
37 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 
38 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>