253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0341 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0341  50S ribosomal protein L36P  100 
 
 		 37 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000597452  unclonable  0.0000000332549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  86.49 
 
 		 43 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  86.49 
 
 		 37 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  83.78 
 
 		 37 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5049  ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2351  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0394  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0622  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0402  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 46 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 46 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 46 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0415  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0391  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  60.1  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 41 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0358  50S ribosomal protein L36  80.56 
 
 		 40 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.47138e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0479  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  75.68 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2621  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.775374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0191  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 48 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000986324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2148  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0657747  normal  0.398863 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4669  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000672096  unclonable  0.00000000651208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0622  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0139923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0234  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000243083  unclonable  0.00000771527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2610  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142007  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3503  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000992018  hitchhiker  0.0000000744799 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4035  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000035995  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 55 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0252  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3738  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000224875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4255  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277487  unclonable  0.00000000000170252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0217  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000098301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0179  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0220  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000362841  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0215  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000134125  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0169  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000409443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0220  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000946708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0837  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4149  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0274  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4290  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.856971  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3899  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4294  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1213  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>